El Laboratorio de Veterinaria, tiene la misión de brindar servicios de diagnóstico de las enfermedades de animales en el territorio, y con este fin cumple las funciones específicas siguientes:

1. Desarrollar proyectos de investigación en temáticas relacionadas con la epizootiología y el diagnostico.
2. brindar servicios de diagnóstico de las enfermedades de animales en el país a partir de las metodologías, procedimientos y normas técnicas actualizadas a nivel nacional e internacional en las ramas de bacteriología, virología, patología, parasitología y bioquímica.
3. participar en el esclarecimiento de casos complejos donde se hacen estudios integrales y se brindan recomendaciones para su solución.
4. asesorar y controlar los laboratorios de menos jerarquía (territoriales) que integran la red de diagnóstico.
5. coadyuvar a la superación, formación y recalificación de especialistas.

Para el cumplimiento de su misión y funciones cuenta con una estructura plana que se expresa a continuación: un Jefe de laboratorio, doce Especialista A Integral en Actividades Pecuarias y Veterinaria, un Técnico en Ensayos Físicos Químicos y Mecánicos y un Especialista B Integral en Actividades Pecuarias y Veterinaria.